O tratamento é feito com antibióticos, a serem iniciados de imediato quando os sinais e sintomas forem graves e o exame de urina, positivo, podendo ser modificados quando os resultados da cultura estiverem disponíveis.
Em geral, o tratamento por três a cinco dias é suficiente nas mulheres; nos homens, pode ser necessário um período maior. Além disso, algumas vezes é recomendada a “lavagem” das vias urinárias, com ingestão de grande quantidade de líquido.